L’École est partie prenante de cinq des Labex retenus. Deux d’entre eux sont portés par le PRES HESAM, il s’agit de TEPSIS (Transformation de l’État, politisation des sociétés, institution du social), porté par Richard Rechtman (directeur d’études), et de DynamiTe (Dynamiques territoriales et spatiales). Ces deux Labex, et TEPSIS en particulier, rassemblent de nombreux membres de l’École et de ses unités de recherche.

Deux Labex toulousains ont également été sélectionnés : IAM-TSE (Incitations, acteurs et marchés : École d’économie de Toulouse) et SMS/SSW (Structuration des mondes sociaux). Enfin, la reconnaissance du Réseau français des IEA comme Labex, porté par Alain Peyraube (directeur d’études), est une bonne nouvelle pour l’École, partenaire de l’IEA Paris.