Lors du conseil d'administration inaugural de la fondation, mercredi 16 décembre 2009, Jean-Claude Waquet, président de l'EPHE, a été élu président de la fondation Campus Condorcet et  Jean-Loup Salzmann, président de Paris-XIII Nord, trésorier.
Béatrice de Durfort, déléguée générale du Centre français des fondations, Jean-Pierre Duport, préfet honoraire et Roland Peylet, conseiller d'État, ont été élus personnalités qualifiées.